ダヴィンチの設計図を盗むためにヴェネチアの屋敷に潜入する三銃士。
ダルタニアン、パリに出てくる。
TP#1・・・枢機卿衛兵を倒すダルタニアン＋三銃士。

FHSC・・・枢機卿の謀略。
P1・・・バッキンガム公爵が飛行船に乗って到着。
ＭＰ・・・首飾りを盗まれる。
SHSC・・・首飾りを奪い返す。
P2・・・奪い返す。
LP・・・ロシュフォールに奪われる。ダルタニアン捕らえられる。

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ＯＰ・・・脱獄。
I・I・・・
核の発射コードが書かれた機密ファイルを盗まれる。
GL・・・
コバルトによる核ミサイル発射を阻止。
TP#1・・・クレムリンに潜入するも爆破に巻き込まれる。

FHSC・・・ドバイへgo。
P1・・・IMF長官が殺される。
ＭＰ・・・コバルト、モローと発射コードの取引。
SHSC・・・ミサイル発射阻止。
P2・・・コバルトに逃げられる。
LP・・・

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ＯＰ・・・
キエフ駅で追われるボーン。
何かの計画遂行を断るボーンのフラッシュ。
I・I・・・
ロスと逃亡。
ロス殺される。
GL・・・
自分の正体を明らかにする。
TP#1・・・ロスのメモから、ブラックライアー計画の情報元・ダニエルズのいるマドリードへ。
ダニエルズいない。
ニッキーの助けを借りて逃亡。
タンジールにてダニエルズが爆死。
殺し屋に追われる。
ＭＰ・・・ダニエルズの所持品からＮＹのＣＩＡの住所が。
ヴォーゼンの金庫からブラックライアー計画について記された極秘資料を盗むボーン。
TP#2・・・パメラから研究所の場所を示す暗号を教えてもらうボーン。
CL・・・
パメラ、ボーンから受け取った極秘資料をＦＡＸ送信。
ハーシュ博士に会い、ボーンが自ら志願して暗殺者となったことが明らかになる。
逃亡するも撃たれるボーン。川へ。
ED・・・

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ＯＰ・・・ネスキー殺害の断片的に思い出して苦しむ。
I・I・・・刺客に追われる。マリーが殺される。
GL・・・ＣＩＡを追う。
TP#1・・・マリーと住んでいた家を出る。
CIA・パメラを追いかける。
ＭＰ・・・
トレッドストーン・パリ支部に勤めていたニッキーに、なぜ狙うのかを聞く。
諜報員と情報屋が殺害されて、ボーンの指紋が残っていたこと。
アボットがトレッドストーンのボスだったこと。
ネスキー殺害のこと。
etc。
LP・・・ホテルにてネスキー夫妻を殺害した過去をはっきり思い出す。
TP#2・・・
アボットが、邪魔なネスキーを殺すよう指示を与えて、ロシアの実業家と石油の採掘権とCIAの金を分け合っていた事実が発覚。
その事実を隠蔽するために、諜報員が持っていたファイル（アボットにとってはよろしくない資料）を奪い、死んだはずのボーンに責任をなすりつけようとしていた。
アボットが自殺。
アボットの告白を録音したレコーダーはパメラのもとに。
CL・・・
ロシアの実業家の刺客に追われるも、カーチェイスの末に撃退。
ED・・・
ネスキーの娘に謝罪。
パメラに自分の本当の名前、生年月日を教えてもらう。

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ＯＰ・・・地中海に浮かんでいるボーン。
I・I・・・追われるボーン。
GL・・・逃げる。記憶を取り戻す。
TP#1・・・マリーとパリを目指すことに。
ＭＰ・・・ケインが滞在していたホテルへ。
LP・・・暗殺者に狙われる？　マリーと別れる？
TP#2・・・トレッド・ストーン計画を知るボーン。デッドと待ち合わせの約束。
CL・・・
ボーンは、ケインになりすまして船に乗りウィボンを殺害する予定だった。
トレッド・ストーンパリ支部に乗り込むボーン。
結局、デッドは局長の支持により別の暗殺者に殺害される。
ED・・・マリーの店に現れるボーン。

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